重点实验室实行“开放、流动、联合、竞争”的运行机制。实行实验室主任全面负责制，具体工作由各实验室副主任实施；实验室成员建立聘任、聘用合同制，培养高素质的复合型人才队伍；建立健全竞争机制、激励机制和各机构制衡机制，提高竞争水平；建立科技成果孵化、转化和科技生产一体化机制；创造条件,拓宽渠道,推进学术联合；树立国际化开放理念，多渠道全方位提高实验室开放水平。为规范实验室的管理，制订了《实验室管理制度》、《实验室管理人员条例》、《实验室大型仪器管理条例》、《实验室危险品管理制度》、《开放课题管理办法》、《研究生日常管理办法》等20余项规章管理制度，通过建章立制，进行有序地管理实验室日常工作与科学研究。
